تأسست الجامعة وفق قانون تأسيس الكليات والجامعات الأهلية في العراق رقم (١٣) لسنة ١٩٩٦ المعدل ، وذلك باسم: (جامعة الإمام جعفر الصادق (ع) الأهلية) وإن الجهة المعتمدة في تسجيلها لدى وزارة التعليم العالي والبحث العلمي، (مؤسسة دار الإسلام الخيرية)، فهي الجهة المسؤولة عن رعاية هذه الجامعة، وادارة شؤونها العامة حسب القانون.
وبهذا اكتسبت الجامعة صفتها الرسمية، وأصبحت من الجامعات الأهلية المعترف بها في العراق حسب القانون.
كما للجامعة سبعة فروع في المحافظات من ضمنها فرع "ديالى" والتي تم الاعتراف بها رسميا من قبل وزارة التعليم العالي والبحث العلمي استنادا لأحكام المادة (٥٧/ ثالثا) من قانون التعليم العالي الاهلي رقم (٢٥) لسنة ٢٠١٦، " وفق كتاب الوزارة ذي العدد: ت ه ا ك المرقم (٣٨٥١) في تأريخ ٢٠١٧/٥/٣٠ "
وتضم جامعة الامام جعفر الصادق (ع) فرع ديالى قسمين:
* قسم علوم القرآن :
هو احد اقسام جامعة الامام جعفر الصادق (ع) فرع ديالى تأسس منذ تأسيس الجامعة وتم الاعتراف به رسميا من قبل وزارة التعليم العالي والبحث العلمي في تأريخ ٢٠١٧/٥/٣٠.
ويقبل هذا القسم خريجي : أحيائي + تطبيقي + علمي + أدبي + وخريجو مراكز التدريب المهني التي تكون مدة الدراسة فيها ثلاث سنوات والذين أدوا الامتحان الوزاري في الاختصاص المناظر + الإعداديات الاسلامية التابعة للتربية (صباحي ومسائي) + الاعداديات الاسلامية التابعة للوقفين (الدراسة الصباحية طلبة الدراسة الخارجية ( من أدوا الامتحان التقويمي فقط) + معهد إعداد معلمين (قسم الدراسة الاسلامية، قسم اللغة العربية) يتم قبول خريجي معهد السياحة في السياحة الدينية إضافة إلى المدخلات السابقة.
*قسم القانون :
هو احد اقسام جامعة الامام جعفر الصادق (ع) فرع ديالى تأسس منذ تأسيس الجامعة وتم الاعتراف به رسميا من قبل وزارة التعليم العالي والبحث العلمي في تأريخ ٢٠١٧/٥/٣٠.
ويقبل هذا القسم خريجي : أدبي - علمي - احيائي - تطبيقي.